9月28日，在“四川大學(xué)125周年校慶活動(dòng)暨第七屆生物醫(yī)學(xué)大數(shù)據(jù)·智能技術(shù)應(yīng)用峰會(huì)”開(kāi)幕式上，四川大學(xué)華西醫(yī)院、華為技術(shù)有限公司、賽樂(lè)基因科技（北京）有限公司聯(lián)合發(fā)布多組學(xué)數(shù)據(jù)加速分析平臺(tái)，該平臺(tái)基于GPU加速，集數(shù)據(jù)存儲(chǔ)、計(jì)算、管理、使用為一體，旨在推動(dòng)基因測(cè)序技術(shù)創(chuàng)新，加速醫(yī)療行業(yè)數(shù)字化轉(zhuǎn)型。
華西醫(yī)院、華為、賽樂(lè)基因聯(lián)合發(fā)布“多組學(xué)數(shù)據(jù)加速分析平臺(tái)”
目前，基于該平臺(tái)已經(jīng)取得重大階段性進(jìn)展：30X人類(lèi)WGS胚系變異分析時(shí)間從24小時(shí)縮短至7分鐘，這是全球首次將人類(lèi)全基因組分析推進(jìn)至分鐘級(jí)時(shí)代，在多組學(xué)數(shù)據(jù)分析領(lǐng)域具有跨時(shí)代的意義。
隨著新一代基因測(cè)序技術(shù)（Next Generation Sequencing，NGS）和測(cè)序儀的發(fā)展，基因測(cè)序速度不斷提升，測(cè)序成本不斷下降，人類(lèi)全基因組的測(cè)序成本從過(guò)去的30億美金已經(jīng)下降到500美金，由此帶來(lái)了基因相關(guān)科學(xué)研究和應(yīng)用的快速發(fā)展，目前基因測(cè)序技術(shù)已經(jīng)在生育健康、腫瘤個(gè)體化診斷和治療、遺傳病、傳染病檢測(cè)、疫苗研發(fā)等領(lǐng)域獲得廣泛的應(yīng)用，為精準(zhǔn)醫(yī)療和個(gè)性化醫(yī)療帶來(lái)眾多革命性創(chuàng)新。
與基因行業(yè)的快速爆發(fā)相對(duì)應(yīng)，基因測(cè)序數(shù)據(jù)則呈現(xiàn)指數(shù)級(jí)增長(zhǎng)趨勢(shì)，未來(lái)有可能比肩天文數(shù)據(jù)量。當(dāng)前每臺(tái)最先進(jìn)的基因測(cè)序儀每天產(chǎn)生的測(cè)序數(shù)據(jù)已經(jīng)達(dá)到6TB，每年產(chǎn)生的數(shù)據(jù)則高達(dá)數(shù)十PB，且需要永久保存。為了及時(shí)分析這些海量的基因數(shù)據(jù)，測(cè)序企業(yè)和科研機(jī)構(gòu)往往需要投入高額資金建設(shè)高性能計(jì)算集群和數(shù)據(jù)中心。因此，基因數(shù)據(jù)的分析速度與成本日益成為掣肘基因測(cè)序行業(yè)發(fā)展的關(guān)鍵因素。如何提升基因數(shù)據(jù)的分析效率、降低成本投入成為業(yè)內(nèi)公認(rèn)必須解決的新課題。
此次三方創(chuàng)新合作，充分發(fā)揮了華西醫(yī)院在多模態(tài)組學(xué)數(shù)據(jù)分析和基因應(yīng)用等領(lǐng)域的領(lǐng)先學(xué)術(shù)和產(chǎn)業(yè)優(yōu)勢(shì)，華為公司在高性能數(shù)據(jù)存儲(chǔ)和先進(jìn)基因數(shù)據(jù)管理系統(tǒng)上的技術(shù)積累，以及賽樂(lè)基因在GPU加速生物信息數(shù)據(jù)分析領(lǐng)域的行業(yè)經(jīng)驗(yàn)。面向未來(lái)，三方的創(chuàng)新合作有望在基因測(cè)序領(lǐng)域，以數(shù)據(jù)為驅(qū)動(dòng)，以創(chuàng)新為引擎，加速數(shù)據(jù)與存儲(chǔ)技術(shù)賦能生物科技產(chǎn)業(yè)，促進(jìn)甚至引領(lǐng)醫(yī)療行業(yè)的數(shù)字化變革。
華西醫(yī)院數(shù)據(jù)科學(xué)家于浩澎博士發(fā)表演講
“多組學(xué)大數(shù)據(jù)時(shí)代已經(jīng)到來(lái)，華西醫(yī)院多組學(xué)數(shù)據(jù)加速分析平臺(tái)創(chuàng)新性地引入華為OceanStor Pacific面向多樣化算力的融合分析數(shù)據(jù)底座，以及賽樂(lè)基因BaseNumber基因數(shù)據(jù)分析GPU加速方案，推動(dòng)多組學(xué)數(shù)據(jù)分析邁入分鐘級(jí)時(shí)代?！比A西醫(yī)院數(shù)據(jù)科學(xué)家于浩澎博士在下午的演講中提到，“此項(xiàng)研究成果的發(fā)布，將加速精準(zhǔn)醫(yī)療大數(shù)據(jù)在醫(yī)學(xué)上的廣泛應(yīng)用?！?/p>
華西醫(yī)院作為醫(yī)學(xué)科研機(jī)構(gòu)的龍頭，深刻理解醫(yī)療行業(yè)業(yè)務(wù)需求，賽樂(lè)基因在基因數(shù)據(jù)分析技術(shù)領(lǐng)域深耕多年，華為公司則能提供最好的數(shù)據(jù)基礎(chǔ)設(shè)施平臺(tái)。此次ICT技術(shù)與生命科學(xué)的融合創(chuàng)新，將加速智慧醫(yī)療產(chǎn)業(yè)發(fā)展，為未來(lái)的基因科學(xué)做出貢獻(xiàn)，促進(jìn)人類(lèi)的健康福祉。
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