在華為開發(fā)者大會2020(Cloud)期間，華為云發(fā)布全新AutoML工具AutoGenome，支持對基因組數(shù)據(jù)進行全自動AI建模，助力科研人員探索生命奧秘。
目前，AI技術(shù)已經(jīng)廣泛應(yīng)用在圖像、語音等領(lǐng)域，然而在生物醫(yī)學(xué)領(lǐng)域，尤其是基因組學(xué)數(shù)據(jù)領(lǐng)域，AI的應(yīng)用仍處于初期階段。主要原因是，由于基因組數(shù)據(jù)的復(fù)雜性，導(dǎo)致主流的基于圖像和文本的模型不能很好地對基因組數(shù)據(jù)進行建模;同時，由于AI模型的搭建開發(fā)門檻較高，需要開發(fā)者有比較多的經(jīng)驗。
華為云發(fā)布的AutoGenome，采用了超參數(shù)自動搜索、神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)架構(gòu)自動搜索和模型自動解釋器等最新的AutoML技術(shù)，并且提出了全新的更加適用于基因組數(shù)據(jù)建模的殘差全連接網(wǎng)絡(luò)，在多項不同的基因組數(shù)據(jù)建模任務(wù)中，AutoGenome的準(zhǔn)確性都超出傳統(tǒng)模型5個百分點以上。
在開發(fā)過程上，AutoGenome對于AI的初學(xué)者非常友好，用戶在華為云ModelArts一站式AI開發(fā)管理平臺可以一鍵啟動Notebook開發(fā)環(huán)境，只需要五行代碼即可快速完成端到端的基因組數(shù)據(jù)建模、準(zhǔn)確性評估和模型結(jié)束。
AutoGenome Examples已經(jīng)列入華為云ModelArts Notebook任務(wù)中
此外，華為云還聯(lián)合華為2012實驗室媒體院研發(fā)了autosearch自動化搜索框架并預(yù)置在華為云一站式AI開發(fā)管理平臺ModelArts中，可以集成更多的automl搜索算法，便于支持更多的基因建模能力。
大會期間，中科院基因組所韓大力教授也現(xiàn)場分享了如何利用AutoGenome對羥甲基化組學(xué)數(shù)據(jù)進行建模，從而實現(xiàn)對肝癌的診斷。該案例中，借助AutoGenome的自動建模比文獻報道的同類工作準(zhǔn)確率高出八個百分點。
目前，AutoGenome已經(jīng)正式上線，用戶可在華為云ModelArts一站式AI開發(fā)管理平臺上使用。
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