過去的一年,蛋白質(zhì)組學(xué)在研究和臨床上都取得了蓬勃發(fā)展,華大基因蛋白質(zhì)組學(xué)也始終以提供更優(yōu)質(zhì)的科技服務(wù)為目標(biāo),不斷提升產(chǎn)品水平和質(zhì)量,在今年完成了蛋白定量類全線產(chǎn)品優(yōu)化升級,蛋白修飾類產(chǎn)品整體質(zhì)量提升,并推出空間蛋白質(zhì)組等多項(xiàng)新產(chǎn)品助力前沿科學(xué)研究。 現(xiàn)在,邀您一同回顧我們不斷前進(jìn)的科研印記!
NO.1蛋白定量類全線產(chǎn)品優(yōu)化升級
蛋白質(zhì)組定量可以對一個基因組表達(dá)的全部蛋白質(zhì)或一個復(fù)雜混合體系內(nèi)所有蛋白質(zhì)進(jìn)行精確鑒定和定量,用于篩選和尋找任何因素引起的樣本之間的差異表達(dá)蛋白質(zhì),結(jié)合生物信息學(xué)分析揭示生命體生理病理功能,同時也可對某些關(guān)鍵蛋白質(zhì)進(jìn)行定性和定量分析,是目前蛋白質(zhì)組學(xué)研究最重要的方向之一。
華大科技蛋白定量在今年全面優(yōu)化升級,推出多項(xiàng)新產(chǎn)品和新服務(wù)、數(shù)據(jù)分析能力全面提升,從高通量數(shù)據(jù)到高效率分析全覆蓋,進(jìn)一步助力數(shù)據(jù)深度挖掘。
1. 標(biāo)記蛋白定量,檢測通量再升級
IBTpro-16plex和TMTpro-18plex全新升級,可分別同時對多達(dá)16例和18例樣品進(jìn)行蛋白定量,進(jìn)一步助力定量多元化。此類產(chǎn)品也適用于磷酸化蛋白定量。
2. 非標(biāo)記DDA和DIA等蛋白定量產(chǎn)品信息分析全面升級
新增多條質(zhì)控內(nèi)容、結(jié)果目錄一目了然、報(bào)告展示結(jié)構(gòu)優(yōu)化,提供更加人性化的分析報(bào)告及結(jié)果。
3. 新增及升級多項(xiàng)高級分析和多組學(xué)關(guān)聯(lián)分析服務(wù)
機(jī)器學(xué)習(xí):不基于任何假設(shè)直接從數(shù)據(jù)中發(fā)現(xiàn)分子間內(nèi)在規(guī)律,有助于更好地理解疾病發(fā)生、發(fā)展的復(fù)雜機(jī)制,是精準(zhǔn)醫(yī)療領(lǐng)域的一個重要工具。
GSEA、WGCNA:從海量數(shù)據(jù)中挖掘與生物學(xué)意義相關(guān)的蛋白,識別已知蛋白的新功能、尋找新調(diào)控蛋白,深入了解調(diào)控機(jī)制。
蛋白-代謝多組學(xué)關(guān)聯(lián)分析:從“因”和“果”探究生物學(xué)問題,相互間進(jìn)行驗(yàn)證,進(jìn)而深入開展后續(xù)研究與應(yīng)用,全面了解生物系統(tǒng)調(diào)控機(jī)制。
NO.2蛋白修飾類產(chǎn)品整體質(zhì)量提升
許多蛋白質(zhì)是在發(fā)生翻譯后修飾起作用的。以人體為例,50%以上蛋白質(zhì)發(fā)生蛋白翻譯后修飾(PTM),其在細(xì)胞生物過程中起看重要的調(diào)節(jié)調(diào)控作用,蛋白修飾類研究對闡釋細(xì)胞生理過程、疾病的發(fā)生發(fā)展機(jī)制都具有重要意義。今年,華大科技蛋白修飾類產(chǎn)品整體質(zhì)量提升,實(shí)現(xiàn)富集效率、檢測通量、鑒定深度、準(zhǔn)確度等全面優(yōu)化升級。
1. 4D-DIA磷酸化蛋白質(zhì)組通量、鑒定數(shù)等多維提升
全新流程提升富集效率,自動化移液工作站提升檢測通量,縮短周期,同時降低批次效應(yīng),鑒定深度、定量準(zhǔn)確性均有大幅提升,腫瘤組織1h鑒定磷酸化肽段達(dá)15,000+,水稻苗11,000+,同時和定量蛋白質(zhì)組學(xué)強(qiáng)強(qiáng)聯(lián)合,多組學(xué)關(guān)聯(lián)分析探索蛋白質(zhì)表達(dá)“全景圖”。
2. 乙酰化蛋白質(zhì)組、泛素化蛋白質(zhì)組富集效率、鑒定數(shù)全面提升
采用進(jìn)口金標(biāo)抗體,高效富集修飾肽段,4D label-free方法進(jìn)行蛋白定量,提高了離子利用率和鑒定準(zhǔn)確度,以更少上樣量、更快掃描速度,全面提升蛋白質(zhì)組學(xué)的覆蓋深度、靈敏度、通量。
3. 糖基化修飾蛋白質(zhì)組推出N-連接完整糖肽產(chǎn)品,實(shí)現(xiàn)新突破
具有更高鑒定深度的同時,可以獲得糖鏈、糖基化修飾肽段及糖鏈和糖基化位點(diǎn)的對應(yīng)關(guān)系,并對糖鏈結(jié)構(gòu)進(jìn)行精確解析,一步到位,為蛋白糖基化研究提供更全面的解決方案。
NO.3新增多項(xiàng)前沿蛋白質(zhì)組學(xué)服務(wù)
空間組學(xué)被Nature評為2022年7大“顛覆性”技術(shù)之一,蛋白質(zhì)是生命活動的執(zhí)行者,在組織空間層面進(jìn)行蛋白質(zhì)組研究,對于解析組織微環(huán)境、診斷及預(yù)后、以及精準(zhǔn)醫(yī)療具有重要的價值。華大科技蛋白質(zhì)組緊跟國際前沿研究趨勢,于今年推出了空間蛋白質(zhì)組學(xué)助力空間維度的探索。同時,還推出了Olink蛋白質(zhì)組學(xué)和單克隆抗體蛋白從頭測序服務(wù),進(jìn)一步豐富蛋白質(zhì)組解決方案,為廣大用戶提供更加多樣化的選擇!
1. 空間蛋白質(zhì)組學(xué)
常規(guī)蛋白質(zhì)組學(xué)從整個組織或數(shù)百萬細(xì)胞入手,得到的是一群細(xì)胞中信號的平均值,缺少細(xì)胞的空間信息,通過測量空間維度蛋白質(zhì)組數(shù)據(jù),將能更準(zhǔn)確地反映特定的細(xì)胞功能和狀態(tài)。
華大科技質(zhì)譜平臺在空間蛋白領(lǐng)域深耕多年,連續(xù)發(fā)表了胃印戒癌和結(jié)直腸癌空間蛋白質(zhì)組相關(guān)文章,今年重磅推出空間蛋白組學(xué)產(chǎn)品,提供從組織切片、到LCM切割、質(zhì)譜上機(jī)、信息分析的全流程服務(wù),專業(yè)博士團(tuán)隊(duì)全程指導(dǎo),采用timsTOF Pro高性能質(zhì)譜儀進(jìn)行檢測,在鑒定深度、定量穩(wěn)定性和準(zhǔn)確性方面均表現(xiàn)優(yōu)異。
2. Olink蛋白質(zhì)組學(xué)
Olink蛋白質(zhì)組學(xué)提供所有靶向panel蛋白質(zhì)組學(xué)檢測,可以廣泛應(yīng)用在心血管、腫瘤、神經(jīng)系統(tǒng)、免疫等疾病研究領(lǐng)域,提供超靈敏、無偏、靶向蛋白組學(xué)解決方案,尤其適用于大隊(duì)列疾病研究!
3. 單克隆抗體蛋白從頭測序
基于質(zhì)譜的蛋白質(zhì)從頭測序技術(shù),無需數(shù)據(jù)庫、無需參考序列,僅提供少量的純化蛋白,即可獲得完整的蛋白質(zhì)序列信息。為了滿足廣大科研工作者對蛋白質(zhì)測序的強(qiáng)烈需求,華大科技蛋白質(zhì)組在今年推出蛋白從頭測序服務(wù),并針對抗體研發(fā)相關(guān)領(lǐng)域,特別推出單克隆抗體蛋白從頭測序(簡稱“單抗測序”)服務(wù)。
NO.4代表性文章
在過去的一年中,我們參與的蛋白組科研工作百花齊放、碩果累累,多篇文章發(fā)表于SCI核心期刊,現(xiàn)選取兩篇代表性文章與各位老師分享
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