近年來,人工智能作為一種逐漸發(fā)展和不斷完善的新興技術(shù),被廣泛應用到各個行業(yè)。在關(guān)乎人類生命健康的醫(yī)學領(lǐng)域,醫(yī)藥企業(yè)也不斷借助AI突破新藥研發(fā)瓶頸。新藥研發(fā)是技術(shù)含量高、成本投入大、且耗時最為漫長的技術(shù)研究領(lǐng)域之ー,一款新藥的研發(fā)周期往往長達數(shù)年甚至十余年。藥物研發(fā)作為一種數(shù)據(jù)密集型行業(yè),與AI需要大量數(shù)據(jù)訓練的特點相吻合。將AI應用于藥物研發(fā),一定程度可優(yōu)化傳統(tǒng)的經(jīng)驗型藥物研發(fā)范式,提升新藥研發(fā)效率。
望石智慧(StoneWise),就是率先利用AI驅(qū)動新藥研發(fā)的科技公司。公司專注于AI新藥研發(fā)(AIDD)底層理論的開發(fā)和技術(shù)的落地,旨在用技術(shù)與創(chuàng)新力為醫(yī)藥行業(yè)帶來新視角,打造世界領(lǐng)先的小分子創(chuàng)新藥研發(fā)平臺。
創(chuàng)新藥的發(fā)現(xiàn)可以類比為“一把鑰匙開一把鎖”,找到與疾病靶點(鎖)最契合的化合物(鑰匙)是藥物研發(fā)的核心之一, 也是望石智慧的主線業(yè)務之一,即“圍繞HIT(苗頭化合物)發(fā)現(xiàn)為核心的AI小分子藥物整合平臺”進行相關(guān)技術(shù)平臺的開發(fā),在全球新、臨床導向的項目中,發(fā)現(xiàn)有專利空間的化合物。目前預估的化學空間約為10^63,探索潛在成藥化合物的過程,就如同在浩瀚無窮的宇宙中,尋找與靶點精準匹配的鑰匙,工作量難以預估。借力AI,可以幫助藥物研究工作者快速、準確地找到符合各類定向需求的鑰匙,但復雜的算法模型訓練和計算任務背后需要巨量的算力支撐。
在此場景下,AI制藥公司面臨著硬件采購資金投入和運維管理壓力較大、且托管與云之間的專線成本高昂等問題,網(wǎng)絡延時也時刻制約著業(yè)務的發(fā)展。且在新藥研究項目的開展過程中,往往會在集中時間段對算力需求大規(guī)模增加,而在其他時間出現(xiàn)資源閑置或浪費的情況。如何讓算力發(fā)揮最大價值也是望石智慧面臨的難點之一。
2021年初,在望石智慧底層理論突破、且項目應用被大規(guī)模商業(yè)化應用之際,中立、安全的云廠商UCloud優(yōu)刻得成為其合作伙伴之一:
>>>使用UCloud快杰云主機、裸金屬物理云等基礎(chǔ)云資源,將訓練負載遷移到云端,與現(xiàn)有的IT基礎(chǔ)設施形成混合云架構(gòu)。彈性、靈活的支持大規(guī)模的訓練托管部署及推理計算任務,節(jié)省IT成本投入。同時,由于新藥研發(fā)數(shù)據(jù)處理量龐大,對服務器的計算性能、穩(wěn)定性以及實時性等有著苛刻的要求,UCloud優(yōu)刻得裸金屬云正能滿足研發(fā)場景下對性能的極高要求。
>>>UCloud優(yōu)刻得還為望石智慧提供基于云計算先進經(jīng)驗的GPU強大算力支持,在降低成本的同時,獲得可靈活部署、彈性擴容的新藥研究訓練體驗;在新藥搜索、推薦、生成等(尤其是基于電子云密度的3D分子生成)高并發(fā)、高吞吐的訓練場景下,UCloud優(yōu)刻得高性能文件存儲可充分滿足研究人員平穩(wěn)流暢的數(shù)據(jù)訪問體驗。
>>>在構(gòu)建全球云計算中心的部署上,基于多年豐富的云計算運維經(jīng)驗和完善的混合云網(wǎng)絡,UCloud優(yōu)刻得為望石智慧打通了現(xiàn)有混合云架構(gòu)下的協(xié)同管理能力,以滿足多元化的業(yè)務快速發(fā)展。并可與望石智慧公有云產(chǎn)品深度結(jié)合,為用戶提供彈性敏捷、高性價比的云計算服務。
當前,在UCloud優(yōu)刻得云平臺和GPU算力支撐之上,望石智慧實現(xiàn)了部分底層理論的突破,構(gòu)建了體系化的AI新藥早期研發(fā)系統(tǒng),以及高效實用的工具平臺StoneMIND®。
在AI新藥研發(fā)底層理論方面,望石首次提出一整套以大分子實驗電子密度為數(shù)據(jù)基礎(chǔ)的AI新藥研發(fā)底層技術(shù)體系,涵蓋了基于靶點口袋的3D分子生成技術(shù)和基于高精度能量計算的高效篩選體系。分子生成模型應用于多個以臨床需求為導向的創(chuàng)新小分子藥物開發(fā),充分的利用實驗電子密度中所包含的口袋與配體之間的互補信息,幫助小分子創(chuàng)新藥設計人員更加高效的應對“基于靶點口袋結(jié)構(gòu)設計小分子”的項目。同時,針對虛擬庫+實體庫的精準、高效的篩選,也逐漸落地,幫助小分子創(chuàng)新藥物設計人員能夠快速的完成“在廣闊化學空間基于靶點口袋的快速、精準的篩選和干濕互動”。
StoneMIND® 系列工具中,Collector具有SaaS平臺、私有化部署、API及桌面端小工具多種形態(tài),能快速高效地從專利、文獻及各類圖片中把化學結(jié)構(gòu)提取出來,并與并性質(zhì)表格快速關(guān)聯(lián),幫助用戶提高批量處理化學結(jié)構(gòu)數(shù)據(jù)效率、快速搭建自有數(shù)據(jù)庫。截至目前已服務用戶10萬個+,一鍵識別化學結(jié)構(gòu)式1百萬次+,批量提取專利或文獻5萬篇+,涵蓋了400+生物醫(yī)藥企業(yè)和科研院所,備受業(yè)內(nèi)認可。聚焦在構(gòu)效分析環(huán)節(jié)的Inspirer(SAR可視化分析及輔助決策工具)通過對化學及生物學數(shù)據(jù)的多維度科學統(tǒng)計分析,可以幫助藥研人員更高效地進行R基團優(yōu)化,從而一站式助力小分子結(jié)構(gòu)修飾和改造。
Collector信息提取體系,秒級繪制復雜結(jié)構(gòu)
用科技擴展生命的邊界,讓每個疾病都有藥可醫(yī)。UCloud優(yōu)刻得將與望石智慧深入合作,用穩(wěn)定可靠、靈活彈性的云服務提供更大算力,支持海量新藥數(shù)據(jù)模型計算,與望石智慧一起探索更快、更好地藥物研發(fā)新范式的建立。
關(guān)于望石智慧
望石智慧(StoneWise),成立于2018年,是一家致力于通過人工智能驅(qū)動新藥研發(fā)的科技公司。公司旨在用技術(shù)與創(chuàng)新力為醫(yī)藥行業(yè)帶來新視角,打造世界領(lǐng)先的小分子創(chuàng)新藥研發(fā)平臺。借助豐富的藥物研發(fā)行業(yè)認知、創(chuàng)新的數(shù)據(jù)集成方法和強大的軟件與工程能力,公司搭建了以靶點口袋研究、分子生成、超高通量虛擬篩選、理性設計、成藥性優(yōu)化為核心的一體化技術(shù)平臺,用于提升新藥研發(fā)中從苗頭化合物發(fā)現(xiàn)至臨床前候選化合物流程中多個關(guān)鍵環(huán)節(jié)的效率與成功率。自成立以來,憑借已被驗證的商業(yè)模式、扎實的技術(shù)根基、綜合的團隊,望石智慧已與多家頭部生物醫(yī)藥企業(yè)達成合作,并獲得了多個AI和醫(yī)藥領(lǐng)域一線投資機構(gòu)的認可。
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