榮之聯(lián)助力仁東醫(yī)學(xué)搭建的生物信息分析處理平臺,包含下機(jī)數(shù)據(jù)處理、數(shù)據(jù)存儲、數(shù)據(jù)管理,數(shù)據(jù)計算、生物信息應(yīng)用平臺等單元,具有高性能、高可靠,易管理,高擴(kuò)展性的特點。
業(yè)務(wù)迅速增長,計算和存儲資源無法滿足
仁東醫(yī)學(xué)(原譽(yù)衡基因)成立于2015年12月,是專門從事基因檢測服務(wù)和基因大數(shù)據(jù)運營的公司。公司作為腫瘤精準(zhǔn)免疫診療領(lǐng)軍企業(yè),基于以二代測序為基礎(chǔ)的多組學(xué)國內(nèi)外研發(fā)團(tuán)隊,通過與臨床專家科研合作積累大量數(shù)據(jù),運用人工智能及大數(shù)據(jù)分析,建立腫瘤精準(zhǔn)免疫治療評價體系和評價標(biāo)準(zhǔn),開發(fā)免疫治療相關(guān)生物標(biāo)志物,秉承服務(wù)創(chuàng)造價值的理念,打造扎實的營銷體系,為腫瘤精準(zhǔn)免疫診療提供全套解決方案。
隨著業(yè)務(wù)量的增長,仁東醫(yī)學(xué)原有的計算和存儲資源很難滿足業(yè)務(wù)的需求。依據(jù)客戶業(yè)務(wù)特點,榮之聯(lián)為其提供端到端的生物數(shù)據(jù)平臺的解決方案。
生物信息分析處理平臺,提升生物信息分析效率
榮之聯(lián)助力仁東醫(yī)學(xué)搭建的生物信息分析處理平臺,包含下機(jī)數(shù)據(jù)處理、數(shù)據(jù)存儲、數(shù)據(jù)管理,數(shù)據(jù)計算、生物信息應(yīng)用平臺等單元,具有高性能、高可靠,易管理,高擴(kuò)展性的特點。
數(shù)據(jù)存儲平臺將參照測序儀的下機(jī)數(shù)據(jù)產(chǎn)量,并結(jié)合業(yè)內(nèi)的數(shù)據(jù)生命周期管理的方式,建設(shè)分布式存儲系統(tǒng)。
在數(shù)據(jù)管理方面,將幫助客戶配置生物信息專用的生物數(shù)據(jù)管理軟件,感知洞察數(shù)據(jù)特征,幫助實現(xiàn)大數(shù)據(jù)及數(shù)據(jù)挖據(jù);實現(xiàn)追蹤系統(tǒng)自動給數(shù)據(jù)添加的屬性,支持客戶和元數(shù)據(jù)的變化,自動提取數(shù)據(jù)特征;支持?jǐn)?shù)據(jù)自帶系統(tǒng)添加的屬性,同時支持客戶自定義數(shù)據(jù)屬性。
數(shù)據(jù)計算平臺將結(jié)合樣本量和數(shù)據(jù)處理速度等,規(guī)劃設(shè)計Bioflow計算節(jié)點,使用Biofolw計算引擎構(gòu)成生物數(shù)據(jù)計算平臺,即Bioflow計算平臺,配置專用的生物信息調(diào)度、計算引擎,可進(jìn)行完整流程編排,流程管理,作業(yè)管理,工具管理,權(quán)限管理等等。
存儲節(jié)點內(nèi)部,以及存儲與計算節(jié)點之間使用萬兆互連,管理網(wǎng)絡(luò)采用千兆互連。
考慮到業(yè)務(wù)的擴(kuò)展性以及未來云平臺的對接,榮之聯(lián)為仁東醫(yī)學(xué)部署了私有的分布式行業(yè)云平臺,后續(xù)存儲平臺可進(jìn)行橫向擴(kuò)展。同時,配置了數(shù)據(jù)管理功能,在數(shù)據(jù)寫入存儲時,即可收集收數(shù)據(jù)的元數(shù)據(jù),可實現(xiàn)快速查收,快速溯源。Bioflow平臺則為客戶定制化生物信息流程,解決客戶分析流程從單機(jī)到集群遷移的難題,并不斷優(yōu)化,提升生物信息分析效率。
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