2020年10月27日,國家基因庫生命大數(shù)據(jù)平臺(CNGBdb)在第十五屆國際基因組學大會(ICG-15)上重磅發(fā)布一項全新功能——生命大數(shù)據(jù)可信計算平臺CODEPLOT。
CODEPLOT是一個集可信計算環(huán)境和多元化在線分析工具于一體的生命大數(shù)據(jù)分析平臺,是國內首個將數(shù)據(jù)加密、區(qū)塊鏈、安全多方計算、基因安全容器虛擬化等最新安全策略應用于生命大數(shù)據(jù)分析利用和合作共享的平臺。其正式發(fā)布將生命大數(shù)據(jù)的安全共享和利用轉化帶上了一個新臺階。
上圖:國家基因庫副研究員丁遠彤博士現(xiàn)場介紹CODEPLOT
CODEPLOT是一個靈活、可信的計算平臺,用戶無需任何編程背景,也可使用該平臺的計算工具進行自動化的生物信息學分析。同時,它采用區(qū)塊鏈和多方安全計算等前沿技術,確保用戶的數(shù)據(jù)安全。
數(shù)據(jù)孤島、數(shù)據(jù)安全、數(shù)據(jù)分析門檻……
生命大數(shù)據(jù)研究面臨新挑戰(zhàn)
大數(shù)據(jù)時代下,生命科學的研究模式已經(jīng)轉化為數(shù)據(jù)驅動的科學發(fā)現(xiàn)模式,高效利用多組學、多層次的大數(shù)據(jù)可有效促進各領域的基礎研究及科研成果轉化。然而,以下痛點仍然有待解決:
當前,生命大數(shù)據(jù)多分散在科研工作者手中或研究單位內部,數(shù)據(jù)孤島化問題嚴重,如何打破這一局面?
數(shù)據(jù)共享有助科學發(fā)展,可是信息安全問題日益突出,如何在保障數(shù)據(jù)安全的情況下進行數(shù)據(jù)共享?
在數(shù)據(jù)驅動的科學發(fā)現(xiàn)模式中,數(shù)據(jù)分析必不可少,但需要交叉學科背景,非專業(yè)人員如何突破高門檻?
……
為了解決生命大數(shù)據(jù)研究中的上述新挑戰(zhàn),CNGBdb打造了集可信計算環(huán)境和多元化在線分析工具于一體的生命大數(shù)據(jù)分析平臺CODEPLOT。
打破孤島/門檻的數(shù)據(jù)安全共享新模式
可信計算平臺CODEPLOT
CNGBdb可信計算平臺CODEPLOT基于區(qū)塊鏈和安全多方計算等技術,以數(shù)據(jù)匯交模塊存儲的海量數(shù)據(jù)為支撐,以靈活工作空間管理模式為核心,同時提供多元化分析工具,全面打通各科研機構之間的數(shù)據(jù)孤島,突破數(shù)據(jù)分析門檻,提升數(shù)據(jù)利用率,促進重大科研項目合作共享及成果轉化。
上圖:生命大數(shù)據(jù)可信計算平臺CODEPLOT
CODEPLOT為用戶提供:
一、可信計算環(huán)境
基于多級權限控制,利用數(shù)據(jù)存儲加密、傳輸加密和安全多方計算等技術,使得用戶能夠在不公布己方數(shù)據(jù)的前提下,完成自有數(shù)據(jù)分析;以“雖彼此不可見,但可共享使用”(即“可用不可見”)的方式,完成協(xié)同分析。同時結合區(qū)塊鏈技術,保證所有數(shù)據(jù)和計算過程均可回溯且不可篡改,為平臺用戶提供可信的計算環(huán)境。
二、多元化工具集
提供常用的生物信息分析流程,包括單細胞聚類scanpy分析、轉錄組差異分析edgeR分析、HMMER基因家族分析、新冠病毒數(shù)據(jù)BLAST檢索等16種分析流程。同時,支持用戶使用流程管理工具WDL搭建自定義的分析流程。
三、個性化工作空間
采用工作空間構建計算沙箱,用戶可在自己的工作空間內選擇分析工具、數(shù)據(jù)集和計算模式。采用單方計算模式時,用戶可單獨針對自有數(shù)據(jù)進行分析,或者與平臺現(xiàn)有的公開數(shù)據(jù)合并分析;采用多方計算模式時,用戶通過共享空間方式與不同地域研究者/研究團隊進行協(xié)作分析。
四、開放式數(shù)據(jù)資源
用戶可以利用三種不同的數(shù)據(jù)集進行分析:1.公開數(shù)據(jù)集,即平臺基于CNGBdb及其他公共數(shù)據(jù)庫(如NCBI、Pfam等)的數(shù)據(jù)資源建成的公共數(shù)據(jù)集,涵蓋植物、動物、微生物、疾病等多個研究領域。2.私有數(shù)據(jù)集,即用戶自行上傳的自有數(shù)據(jù)集。3.授權數(shù)據(jù)集。合作伙伴可以授權對方使用自己的私有數(shù)據(jù)集,以進行聯(lián)合分析。
不論你是否有生信背景,即使你與合作伙伴相隔千里,CODEPLOT都可以幫你完成數(shù)據(jù)分析并實現(xiàn)安全共享!
注:CODEPLOT由CNGBdb團隊設計開發(fā),由華大磐石提供安全相關的技術支持。
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