本文來自微信公眾號“阿爾法公社”(ID:alphastartups),作者:發(fā)現(xiàn)非凡創(chuàng)業(yè)者的。
AI+生物醫(yī)藥領(lǐng)域,DeepMind的AlphaFold是最出名的研究,它幾乎完整解析了所有蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)。AlphaFold的AI系統(tǒng)基于Transformer架構(gòu),而Transformer論文主要的作者Jakob Uszkoreit也已投身AI+醫(yī)藥領(lǐng)域。
Jakob Uszkoreit創(chuàng)立的AI生物技術(shù)公司Inceptive近日獲得a16z、NVIDIA的風險投資部門NVentures以及Obvious Ventures等機構(gòu)投資的1億美元A輪融資,加上此前融資的2000萬美元,它的累計融資額達到1.2億美元,估值超過3億美元,比上一輪翻了兩番。
這筆融資使Inceptive獲得了NVIDIA尖端計算平臺的使用權(quán)限。在目前的芯片短缺情況下,計算能力越來越成為開發(fā)復(fù)雜AI算法的限制因素。
與AlphaFold把目標放到蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)不同,Inceptive的目標是mRNA。它通過搭建一個AI軟件平臺,去尋找和開發(fā)mRNA分子,一旦這些分子通過了實驗室的試驗,則會把這些分子授權(quán)給制藥公司進行臨床試驗,最終變成基于mRNA的疫苗。
目前它已經(jīng)與一些歐洲的大型制藥公司合作,將這項創(chuàng)新的技術(shù)落地。
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Transformer論文作者與斯坦福教授用AI設(shè)計RNA分子
目前Transformer論文的8位作者都已離開Google創(chuàng)業(yè),他們創(chuàng)立了Cohere,character.ai,AdeptAI,Essential AI以及Sakana.ai等,但是這些公司基本集中在ToC或ToB的文本處理相關(guān)的功能上,Jakob Uszkoreit的Inceptive是其中唯一跨界到生物醫(yī)藥,并且更偏向研究的,這是一個理想主義的創(chuàng)業(yè)方向。
Jakob Uszkoreit
“我們希望最大限度發(fā)揮AI在生命科學等領(lǐng)域的積極影響,尤其是生成式AI 在制藥行業(yè)的潛力。我們創(chuàng)辦的公司將會應(yīng)用生成式AI生成生物數(shù)據(jù),用于開發(fā)新療法,而不是生成文本或者圖像。我們想最大化這種AI的積極影響。” Jakob Uszkoreit在談到自己的創(chuàng)業(yè)想法時表示。
大模型先驅(qū)+斯坦福生物教授+連續(xù)創(chuàng)業(yè)者
Inceptive由Jakob Uszkoreit(CEO)、Kevin Heyries(CBO)以及Rhiju Das于2021年聯(lián)合創(chuàng)立。
Jakob Uszkoreit從2008年起就在Google工作,他主導了Google Assistant的NLP團隊。而他并不是在離開Google創(chuàng)業(yè)時才選擇了AI+生物醫(yī)藥方向,在共同寫作《Attention is all you need》這篇論文之前,他就已經(jīng)在探索將AI用于預(yù)測人類蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)。
Rhiju Das是斯坦福大學生物化學與物理學副教授,他過往的研究一直集中在通過模擬和計算設(shè)計RNA分子,他主持著EteRNA大規(guī)模開放實驗室,在2020年,Das及其團隊利用EteRNA實驗室的資源研究開發(fā)了可常溫保存的COVID-19RNA疫苗。
Kevin Heyries曾是AI抗體發(fā)現(xiàn)公司AbCellera的聯(lián)合創(chuàng)始人,親自參與了AbCellera從組建到運營的多個方面,他在創(chuàng)新、業(yè)務(wù)拓展、商業(yè)策略、公司增長等方面經(jīng)驗豐富。
可以看出在這個創(chuàng)始團隊中,Jakob懂AI,Rhiju Das懂生物和RNA,Kevin Heyries既懂技術(shù),又懂商業(yè),形成了很好的互補。
目前,Inceptive擁有一個由超過40位不同學科的專家組成的團隊,他們來自生物學、機器人和人工智能前沿專業(yè),新一輪的融資也將幫助Inceptive繼續(xù)擴展團隊規(guī)模,加強研發(fā)力量。
用AI設(shè)計mRNA
Inceptive的核心是一個能設(shè)計獨特mRNA序列的AI平臺,這種“生物軟件”技術(shù)能夠在實驗室中創(chuàng)建和測試新的分子結(jié)構(gòu)。
這個平臺運行的原理是通過機器學習模型針對性地設(shè)計RNA序列,大大縮短藥物研發(fā)周期來降低研發(fā)成本, 它包括以下環(huán)節(jié):
1.開發(fā)生物軟件,可以將編碼藥物或疫苗的程序代碼編譯成mRNA分子序列。
2.通過機器學習模型,自動搜索和設(shè)計出優(yōu)化的RNA分子序列。
3.利用RNA的高效合成制造能夠表達疫苗或藥物的mRNA分子。
4.構(gòu)建RNA分子設(shè)計、合成、測試的自動化閉環(huán)工作流程。
5.應(yīng)用該技術(shù)平臺,快速開發(fā)新藥和疫苗。
目前Inceptive已有310個試點項目分布在臨床前到臨床試驗的各個階段,也已經(jīng)與一家歐洲大型制藥公司達成合作,共同作開發(fā)一種新型傳染病mRNA疫苗。
Inceptive希望把計算機編程這個范式轉(zhuǎn)移到生物學領(lǐng)域,將軟件的精確性和模塊化引入理性設(shè)計分子中,利用AI工具合理設(shè)計出此前難以實現(xiàn)的新型療法,尤其關(guān)注基于mRNA的疫苗、藥物等新型藥物分子。
據(jù)Jakob Uszkoreit預(yù)估,在未來十年,將有大約700種基于mRNA的藥物。
AI在醫(yī)藥研發(fā)領(lǐng)域的拐點將在3年內(nèi)發(fā)生
盡管已經(jīng)累計獲得1.2億美元的融資,Inceptive仍然處于早期階段,它的技術(shù)平臺和產(chǎn)品保持了一定程度的低調(diào)。Jakob Uszkoreit在創(chuàng)業(yè)階段與一些硅谷投資人有過深度的交流,例如a16z生物+健康板塊的創(chuàng)始合伙人Vijay Pande,從對談中,可以一窺Jakob Uszkoreit這位大模型先驅(qū)者對于AI+生物醫(yī)藥的一些洞見。
Vijay Pande:真正為生物問題明確開發(fā)AI算法是非常罕見的,因為要擁有一個既精通生物學又精通計算機科學領(lǐng)域的團隊實在太困難了。但我很好奇聽聽你的看法,這個領(lǐng)域目前的關(guān)鍵挑戰(zhàn)是什么?
Jakob Uszkoreit:我遇到的關(guān)鍵挑戰(zhàn)是,在生物學領(lǐng)域還沒有大量的數(shù)據(jù),盡管現(xiàn)在的數(shù)據(jù)已經(jīng)比此前的數(shù)據(jù)更多更詳盡了。但是相比AI在其他領(lǐng)域的應(yīng)用,還是太少。
例如,在文字或圖片生成領(lǐng)域,數(shù)據(jù)可以直接從網(wǎng)絡(luò)爬取,深度學習專家對數(shù)據(jù)進行一些清洗,就可以直接用。而生物學領(lǐng)域卻不是這樣,它的數(shù)據(jù)生產(chǎn)更困難,我們需要不同的試驗人員在不同的地方進行很多的試驗。深度學習專家無法自己獲取或掌握數(shù)據(jù)。
所以在這個領(lǐng)域需要有更多深度學習背景的人與生物學背景的人緊密合作,這樣當他們互相了解了彼此的工作,就會有新嘗試和新方法誕生。
Vijay Pande:對于藥物設(shè)計、健康保健等方面,你認為現(xiàn)在AI處于什么階段?還需要做什么?何時能夠達到預(yù)期的目標?
Jakob Uszkoreit:雖然預(yù)測未來總是風險很高,我還是做一個預(yù)測:如果在接下來的三年內(nèi)我們沒有看到機器學習和大規(guī)模深度學習在藥物研發(fā)、藥物設(shè)計方面產(chǎn)生實質(zhì)性影響的話,我會非常驚訝。最初的影響可能會出現(xiàn)在RNA、RNA療法和疫苗等領(lǐng)域,但這絕不會是唯一受到影響的領(lǐng)域,我認為我們確實正走向一個拐點。
Vijay Pande:RNA有什么不同之處?是什么吸引你走向RNA研究,特別是從AI或ML的視角來看?
Jakob Uszkoreit:關(guān)于RNA有趣的一點是它具有很廣泛的適用性,雖然RNA結(jié)構(gòu)預(yù)測并不真的很簡單,但相比蛋白質(zhì)有20多種氨基酸的復(fù)雜結(jié)構(gòu),它只是一個具有四種不同基礎(chǔ)的生物聚合物,可以相對高效地生產(chǎn)。
Vijay Pande:是的,很有可能它是一個更快的反饋循環(huán)。
Jakob Uszkoreit:是的。鑒于我們需要創(chuàng)建大量的數(shù)據(jù)來訓練模型,RNA似乎是目前為止在結(jié)構(gòu)簡單性和合成可擴展性方面最好的組合,這里有巨大的未開發(fā)潛力。
Vijay Pande:是的,我認為特別是有可能實現(xiàn)這種快速周期,無論是在臨床前階段還是更快地進入臨床階段,并且在臨床階段停留的時間更短。
Jakob Uszkoreit:是的,這就是我們所期望的。我們也看到了一些初步的跡象表明這可能是事實,這讓我們非常興奮。
在高需求和數(shù)據(jù)安全的邏輯下,必然誕生一批中國的AI+醫(yī)療公司
現(xiàn)在人們對于生成式AI的應(yīng)用方向主要集中在文生文,文生圖,文生視頻/3D等方向,應(yīng)用的落地領(lǐng)域包括傳媒,營銷,法律,流程自動化等。這個屬于生成式AI應(yīng)用的第一階段。
在下一階段,生成式AI將向更硬核的方向出發(fā),比如生成式AI+機器人,讓機器人變得更聰明,這既能用到制造業(yè),又能應(yīng)用到ToC;又比如生成式AI+科研,將大大加快科技發(fā)展的進度,為人類整體帶來福利。
具體到AI+制藥,目前我們已經(jīng)看到兩種模式,一種是我們曾經(jīng)報道過的Causaly,它的核心邏輯是幫助科學家減少dirtywork,從而加快科研的進度。而本文的Inceptive則是直接作用于RNA分子,用AI來設(shè)計RNA,再與藥廠合作。
歡迎參考阿爾法公社關(guān)于Causaly的原創(chuàng)文章:將藥物研發(fā)速度提高10倍,Causaly獲6500萬美元融資|AlphaFounders
不僅是生物醫(yī)藥的科研,Inceptive的主要投資人a16z認為AI在醫(yī)療上也將大有發(fā)展。
AI在醫(yī)療上要解決兩大問題,一個是降低前置診斷的成本(各種大模型都在刷醫(yī)療執(zhí)照考試的分數(shù)),另一個是降低醫(yī)療保健系統(tǒng)里的人力成本。
解決的方式可能是幫助醫(yī)生預(yù)診斷,看X光片,醫(yī)療機器人等等。
盡管近年來中國的醫(yī)藥研發(fā)在加速,但是因為研發(fā)上的后發(fā)劣勢,以及研發(fā)投入規(guī)模較少(參考下圖),與美國的差距仍然巨大。不過AI+醫(yī)藥研發(fā)卻是一個可以奮起直追的機會。一方面,中國的AI與美國在技術(shù)上并沒有代差,另一方面,醫(yī)藥研發(fā)需要大量的真實數(shù)據(jù),為了數(shù)據(jù)安全,中國需要自己的AI藥物研發(fā)系統(tǒng)。
圖片來自惠每科技的報告
對于醫(yī)療來說,邏輯也是一樣,為了數(shù)據(jù)安全(無論是哪一種行業(yè)的AI模型,都需要大量數(shù)據(jù)訓練),本國的AI+醫(yī)療產(chǎn)品都十分重要。在需求,數(shù)據(jù)安全的邏輯下,很可能誕生一批中國本土的AI+藥物研發(fā)和AI+醫(yī)療健康創(chuàng)業(yè)公司,十分值得期待。
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